ГУП МосНПО "Радон" специализируется на обращении с радиоактивными отходами (РАО) средней и низкой активности, образующимися в народном хозяйстве (в науке, промышленности, медицине, сельском хозяйстве и т.д.). Предприятие осуществляет весь комплекс работ с РАО - их сбор, транспортировку, переработку и хранение, а также проводит радиационно-аварийные работы, радиоэкологический и ртутный мониторинг.

Основное направление деятельности Предприятия; - обеспечение радиационной безопасности москвичей.

В Москве развернута комплексная автоматизированная система экологического мониторинга. МосНПО "Радон" также проводит постоянный контроль стройплощадок, радиационно-опасных объектов и состояния природной среды, ведет просветительскую работу с населением.

Кроме того, МосНПО "Радон" занимается сбором и переработкой РАО из 11 областей Центральной России. Предприятие участвует в разработке общих принципов и практических моделей обеспечения экологической безопасности крупных городов. В рамках координационных технических программ МАГАТЭ сотрудники предприятия привлекаются в качестве экспертов при подготовке рекомендаций для членов этой организации.

Предприятие занимается совершенствованием и разработкой современных методов обращения с радиоактивными отходами, а также систем контроля и защиты окружающей среды.